発達した雨雲の影響により、日高地方は５日深夜から６日未明にかけて激しい雷雨となり、印南町印南原では６日午前０時からの時間雨量が６７㍉という非常に激しい雨となった。
　県によると、日高地方は午前０時ごろから雷を伴った雨が激しくなり、１時までの１時間あたりの雨量は日高川町の山野で５９㍉、日高町の田杭で５７㍉を観測。６日午前９時までの２４時間雨量は日高町田杭で１０６㍉、みなべ町南部で１０２㍉、印南町印南原で１０１㍉に達した。
　ほぼ同じ時間帯は雷も激しく、日高地方の空は数秒おきにカメラのフラッシュのような閃光が走り、たたきつける轟音と地響きに目を覚ました人も多かった。
　日高広域消防は５日午後１１時２３分ごろ、由良町大引の住民から「山に雷が落ちて火のようなものが見える」という通報を受け、消防車が出動したが火災は確認できなかった。また、関西電力田辺営業所によると、県全体で紀中・紀南地方を中心に計４３７０軒、日高地方は日高町で６６０軒、美浜町と由良町で１０軒ずつの停電が発生した。